1、废水指标浓度：如果处理的是生活废水，对菌种的选择没有太多需要考虑的因素，这里主要说一下工业废水，工业废水所含COD指标高水的生化性也不好，很多处理生活废水的菌种是处理不了工业废水的。
2、低可生化性废水：工业废水中所含的氨氮指标也是非常高的，有些设备前端会有预处理设备，可以缓解一下生化池的处理负荷，但是工业废水的生化性很多都是低于0.3的指标，对菌种选择就很重要了。
3、菌落数：所选择的菌种需要考虑所含的有效菌落数。
4、适应能的强弱：细菌投加下去不是立方都能快速繁殖，工业废水里面含有无机物质或者惰性物质，和有毒物质，对细菌的生长本身都有抑制作用。所投加的需要需要详细了解清楚，菌种的适应能力怎样。
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